目的:探讨自动化药房管理系统在门诊药房管理工作中的应用价值。方法:对2014年10月至2016年10月期间江苏省泗洪县中心医院门诊药房管理工作的相关资料进行回顾性研究。在2014年10月至2015年10月期间,该院的门诊药房只进行常规管理,未采用自动化药房管理系统进行管理;在2015年11月至2016年10月期间,该院的门诊药房在进行常规管理的基础上采用自动化药房管理系统进行管理。然后比较采用自动化药房管理系统进行管理前后该院门诊药房每日处理的处方量、处方调配的差错率以及患者取药等候的时间。结果:采用自动化药房管理系统进行管理后,该院门诊药房每日处理的处方量更多、处方调配的差错率更低、患者取药等候的时间更短,与采用自动化药房管理系统进行管理前相比差异有统计学意义(P<0.05)。结论:将自动化药房管理系统应用到门诊药房的管理工作中,能有效地降低处方调配的差错率,增加每日处理的处方量,缩短患者取药等候的时间。