【摘 要】
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喹诺酮耐药性主要与喹诺酮耐药决定区基因突变有关。以45株食源性沙门氏菌喹诺酮耐药株为对象，采取全基因组测序和qPCR法检测parC、gyrA基因突变位点，并对检测方法可靠性、耐药基因突变特征进行了评估和分析。首先将4株沙门氏菌进行二代全基因组测序，根据测序数据分析结果，建立了一种qPCR方法检测gyrA Asp87Tyr、gyrA Asp87Asn、parC Thr57Ser和parC Ser80
【基金项目】
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国家重点研发计划，重要食源性致病菌耐药机制及传播规律研究（2017YFC1600100）；
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喹诺酮耐药性主要与喹诺酮耐药决定区基因突变有关。以45株食源性沙门氏菌喹诺酮耐药株为对象，采取全基因组测序和qPCR法检测parC、gyrA基因突变位点，并对检测方法可靠性、耐药基因突变特征进行了评估和分析。首先将4株沙门氏菌进行二代全基因组测序，根据测序数据分析结果，建立了一种qPCR方法检测gyrA Asp87Tyr、gyrA Asp87Asn、parC Thr57Ser和parC Ser80Ile 这4个突变位点。将沙门氏菌进行qnrS、qnrA、qnrB的PCR检测，发现有31株菌未检出qnr基因。以这31株菌为对象，采取qPCR法筛查基因突变位点，结果发现parC Thr57Ser和gyrA Asp87Asn型突变最常见。将qPCR阳性的10株菌扩增parC、gyrA基因全长并测序，qPCR检测和测序结果完全吻合，说明了qPCR检测的可靠性。全基因组测序和qPCR法相结合的方法用于耐药基因突变筛查，既可以发现新的基因突变，又可以快速筛查大样本的主要突变类型，可作为沙门氏菌耐药性研究的一种可靠手段。
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