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利用36对SSR引物对332份国内普通菜豆、16份国外普通菜豆和29份野生菜豆的遗传多样性进行了分析，等位变异数和多样性指数的计算结果显示，3种生态型普通菜豆遗传多样性由大到小的顺序为国内普通菜豆、野生菜豆和国外普通菜豆；我国贵州、云南、黑龙江等省普通菜豆的遗传多样性较为丰富。基于SSR数据，对377份普通菜豆种质资源进行聚类分析，结果聚为6组，其中29份野生菜豆聚到第1组群，与其他样品无任何交叉；国外16份材料中的11份与我国25份材料聚在第6组，说明国内外普通菜豆的遗传关系要比两者同野生菜豆的遗传关系