【目的】为规范传染病报告要求,提升传染病报告效率与质量,基于疾病分类与代码的应用,建立适用于上海市医疗机构传染病报告的标准编码。【方法】经过调研问卷、文献查阅、专家咨询等方式,整理传染病的病种表,收集传染病病种相应诊断名称,将选取的疾病分类与代码与传染病病种进行逐一匹配。通过一对多、多对一以及增加提示条件关系等方法,梳理出基于疾病分类与代码的上海市传染病报告标准编码库。【结果】通过疾病分类代码与传染病报告病种的关系对应,形成一套便于医疗机构使用的可持续改进的基于疾病分类代码的传染病报告标准编码,并应用于上海市传染病报告管理信息系统试点工作。【结论】本次研究的标准编码可应用于上海市传染病报告信息系统,作为传染病诊断触发报告的基础,改变传统的传染病报告模式,对推进传染病疫情报告管理信息化工作有重要的意义。