【摘 要】
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【目的】了解广西鸭圆环病毒（Duck circovirus, DuCV）的遗传进化特征。【方法】试验于2019—2022年从广西地区采集761份病死鸭临床样本，利用实时荧光定量PCR检测DuCV感染情况。通过PCR扩增DuCV全基因组序列，利用DNAStar分析其与参考毒株核苷酸和氨基酸序列相似性，使用RDP4和SimPlot 3.5.1软件分析DuCV重组事件，采用Mega 7.0软件构建遗传进
【基金项目】
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广西自然科学基金青年科学基金项目（2020GXNSFBA297066）； 广西农业科技资助项目（Z201984、Z202032）；
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【目的】了解广西鸭圆环病毒（Duck circovirus, DuCV）的遗传进化特征。【方法】试验于2019—2022年从广西地区采集761份病死鸭临床样本，利用实时荧光定量PCR检测DuCV感染情况。通过PCR扩增DuCV全基因组序列，利用DNAStar分析其与参考毒株核苷酸和氨基酸序列相似性，使用RDP4和SimPlot 3.5.1软件分析DuCV重组事件，采用Mega 7.0软件构建遗传进化树，应用BioEdit软件分析DuCV Cap蛋白氨基酸变异位点。【结果】DuCV阳性率为22.5%,基因组大小为1 988～1 996 bp。广西DuCV毒株全基因组、Rep和Cap基因与参考毒株核苷酸序列相似性分别为71.9%～99.6%、83.1%～99.9%和52.8%～99.9%。基因重组分析显示，DuCV-GX13-2019和DuCV-GX14-2020存在重组事件。Cap蛋白共有78个氨基酸位点发生突变，与DuCV-1相比，DuCV-2在第3、12、15、23、31、42、56和64位氨基酸处完全变异。广西毒株为DuCV-1和DuCV-2基因型，DuCV-1为主要优势毒株，且DuCV-1b亚型流行最为广泛。【结论】广西地区DuCV发病较严重，部分毒株存在重组事件，Cap蛋白突变率高，DuCV多种亚型均有流行。研究结果为广西地区DuCV流行病学调查提供基本数据。
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