【摘 要】
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基于mtDNA全序列设计109对引物,利用高分辨率溶解曲线技术,对采自江苏省连云港和南通吕四港沿海地区养殖池塘中平均体长(5.23±0.33)cm的脊尾白虾潜在的单核苷酸多态性(SNP)
【机 构】
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江苏海洋大学,江苏省海洋生物产业技术协同创新中心,江苏省农业种质资源保护与利用平台
【基金项目】
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江苏省高等学校自然科学研究重大项目(17KJA240001),江苏省优势学科建设工程项目(PAPD),江苏省“六大人才高峰”创新人才团队项目(2016-HYGC-CXTD-004),江苏省2018年度普通高校研究生科研创新计划项目(KYCX18-2571).
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基于mtDNA全序列设计109对引物,利用高分辨率溶解曲线技术,对采自江苏省连云港和南通吕四港沿海地区养殖池塘中平均体长(5.23±0.33)cm的脊尾白虾潜在的单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛查,以获得脊尾白虾线粒体基因组(mtDNA)上的SNP位点。结果显示,在109对引物中,有80对引物具有特异性扩增结果;高分辨率熔解曲线(HRM)检测分析表明,80对引物中有9对引物的扩增产物中含有SNP位点,共包含16个SNP位点。统计结果显示,脊尾白虾线粒体基因组中的SNP位点均为单倍型,分布频率为0.10/
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