【摘 要】
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目的评价荧光染料SYTO13在高分辨熔解曲线技术(HRM)检测单核苷酸多态性(SNP)位点的基因分型能力和临床适用性。方法实验性能验证。选择经测序确认rs3125734 C>T(Ⅰ类SNP )、rs255758 A>C(Ⅱ类SNP)和rs688C>T三个位点基因型的样本36例，以商业化HRM染料LCGreen Plus为对照，进行SYTO13对Ⅰ类和Ⅱ类SNP以及rs688C>T位点的长片段扩增(
【机 构】
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目的评价荧光染料SYTO13在高分辨熔解曲线技术(HRM)检测单核苷酸多态性(SNP)位点的基因分型能力和临床适用性。
方法实验性能验证。选择经测序确认rs3125734 C>T(Ⅰ类SNP )、rs255758 A>C(Ⅱ类SNP)和rs688C>T三个位点基因型的样本36例，以商业化HRM染料LCGreen Plus为对照，进行SYTO13对Ⅰ类和Ⅱ类SNP以及rs688C>T位点的长片段扩增(107 bp)与短片段扩增(52 bp)基因分型能力的评价。基因分型能力以野生型与纯合突变型的Tm差值ΔTm表示，独立样本t检验比较野生型和纯合突变型的Tm均值，两种染料之间检测能力的比较分析采用配对t检验。临床适用性以随机选取已测序分型的35例样本进行批量均相检测来评价。
结果SYTO13能够清楚直观地对Ⅰ类和Ⅱ类SNP进行基因分型(ΔTmclassⅠ＝0.36±0.05，tclassⅠ＝14.827，PclassⅠ＝0.000；ΔTmclassⅡ＝0.42±0.110，tclassⅡ＝9.539，PclassⅡ＝0.000)。均相检测时SYTO13对Ⅰ类SNP的基因分型直观性更好(ΔTmSYTO13＝0.39±0.027)，而对短片段扩增产物基因分型效果不佳。临床适用性评价结果显示SYTO13对长片段扩增的Ⅰ类和Ⅱ类SNP除个别离群样本外均能准确基因分型，离群样本经复查后也能准确分型。
结论SYTO13可作为HRM染料准确地对长片段扩增的Ⅰ类和Ⅱ类SNP位点进行基因分型，适合于临床常规应用。(中华检验医学杂志，2017, 40：88－94)
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