随着经济的快速发展和工业化进程的加速，水资源的紧缺和污染问题日益突出，严重制约了环境保护和可持续发展。为了促进水资源的合理利用和环境保护，我国自2016年开始，率先在河北省实行水资源税试点，随后在2017年又将试点范围扩大至9个省、自治区、直辖市。水资源费改税试点的实施，对于重污染企业的环保转型和绿色创新行为具有重要的促进作用。基于2014—2021年中国上市重污染企业的面板数据，采用倾向得分匹配法、双重差分模型和中介效应模型实证检验水资源费改税政策对试点地区重污染企业绿色创新行为的影响及作用机制。实证结论显示：水资源费改税对试点地区重污染企业绿色创新具有显著促进作用，且研发投入在其中发挥了有效的中介作用。异质性分析表明：实施水资源费改税更有助于促进重污染企业发明型专利数量的提升，对于国有、高市场化地区和高耗水行业的重污染企业，水资源费改税的绿色创新促进作用更加显著。从加快推进水资源费改税政策在全国范围内的推行，加快推进市场化建设，完善其他环境规制政策，加大研发投入等方面提出水资源税费改革和企业绿色发展的对策建议。