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目的：讨论分析在功能性消化不良55例患者中运用温针灸治疗的临床效果。方法：选择2015年4月至2016年4月于我院就诊的功能性消化不良患者110例，所有患者按照抽签法随机分为两组，一组为试验组患者55例，一组为参考组患者55例，两组患者一律被医院确诊为患有功能性消化不良病症。试验组55例患者中运用温针灸进行治疗，而参考组55例患者选择吗丁啉进行治疗，统计分析两组患者的治疗效果，并将统计分析的数据进行组间对比。结果：试验组55例患者的整体治疗有疗效率为94.55%，高于参考组55例患者的整体治疗有疗效率74.55%，具有显著差别（P<0.05）。结论：功能性消化不良患者运用温针灸进行治疗能够有效提高患者的治疗效果，因此针灸配合康复训练在临床中值得推广，具有临床推广意义。