【摘 要】
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通过YASARA软件对酸诱导兔皮胶原蛋白明胶化过程进行动力学模拟,解析兔皮胶原快速明胶化的分子机制.均方根偏差结果表明,酸处理使胶原蛋白分子的非螺旋区亚基组分分离,但对其
【机 构】
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西南大学食品科学学院,重庆,400715邯郸学院生命科学与工程学院,河北 邯郸,056005;
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通过YASARA软件对酸诱导兔皮胶原蛋白明胶化过程进行动力学模拟,解析兔皮胶原快速明胶化的分子机制.均方根偏差结果表明,酸处理使胶原蛋白分子的非螺旋区亚基组分分离,但对其中单个亚基的构象影响较小.酸处理初期,兔皮胶原三螺旋区的氢键在短时间内被迅速破坏,模拟50 ns后,氢键数量保持相对稳定,与实际研究结果一致.三螺旋结构在酸处理初期伴随着氢键的破坏并向其他二级结构转化,随着模拟时间的延长,α-螺旋与β-折叠相对含量之和呈先增加后减少趋势.当α-螺旋和β-折叠相对含量之和达到最大时,明胶化程度最佳.
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