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雾灵山自然保护区植物资源丰富,有许多是国家发布的濒危植物.还有一些是本地数量稀少,值得保护的植物,却未在国家保护名录中出现.2001～2004年在保护区6个分区设置177块样地进行标准地调查,根据植物的标准地分布频度、确限度、采样区分布频度、分布多度评价植物数量的稀少程度,评价结果为Ⅰ级12种、Ⅱ级26种、Ⅲ级68种、Ⅳ级134种、Ⅴ级233种.