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目的 分析龙岩市2012年病毒性脑炎病例柯萨奇B组病毒5型(CVB5)的基因特征.方法 采集患者脑脊液进行病毒分离,用中和试验确定毒株血清型,用008-013 (GCRTGCAATGAYTTCTCWGT/ GGIGCRTTIC-CYTCIGTCCA)和012-011 (ATGTAYGTICCICCIGGIGG/GCICCIGAYTGITGICCRAA)两对引物分段扩增VP1区,进行序列分析.结果 从152份患者脑脊液标本中,分离出2株CVB5,其部分VP1编码区序列长度为469/434个核苷酸,编码156/144个氨基酸.2株核苷酸同源性为92％,氨基酸同源性86％;与原型株Faulkner的核苷酸同源性73％～77％,氨基酸同源性82％～91％.与2011年3株龙岩分离株的核苷酸同源性83％～92％,氨基酸同源性78％～93％.系统进化树分析显示,2株龙岩分离株同属D组基因型.结论 龙岩市2012年流行的CVB5病毒株出现了较大变异,患者可能出现神经系统并发症.应加强对CVB5株所致疾病的监测及其遗传进化的研究,为相关疾病防控提供依据.