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玛旁雍错湿地是西藏高原典型的脆弱生态系统，拥有比较丰富的动植物和旅游资源，具有重要的生态保护利用价值。玛旁雍错湿地目前存在的主要问题为：湖泊周围固体废弃物污染较严重；过度放牧、湿地周边植被破坏、湿地周围蝗虫和鼠（兔）害严重、气候变暖干等因素导致湿地系统内土地沙化和荒漠化日趋加剧；湿地面积日趋萎缩；野生动物资源受到严重威胁。针对上述问题，提出了该湿地资源保护利用的具体措施。