基于模糊理论预测CpG岛新方法

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：qinzhen

【摘要】

：

启动子区域的CpG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一。目前已经建立的一些CpG岛的预测思想和方法都有自身的缺点，基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定CpG岛，能更

【作者】

：

王金龙苏建忠王芳崔颖张岩

【机构】

：

哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院

【出处】

：

生物信息学

【发表日期】

：

2009年2期

【关键词】

：

CPG岛模糊理论隶属函数截集 CpG islands fuzzy membership function cut set

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启动子区域的CpG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一。目前已经建立的一些CpG岛的预测思想和方法都有自身的缺点，基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定CpG岛，能更容易地找到被以往方法所忽略的具有更多生物学意义的CpG岛。本研究通过构建属于CpG岛集合的隶属函数，计算候选序列的隶属度，找出所有的可接受隶属程度的CpG岛。将该方法应用于UCSC数据库中的一段序列（hg18．chr1．31618510.31623510.-1000）进行预测，发现提高了预测的精确度。可见应用模糊理论预测CpG岛具有一定

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