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对大刺鳅（Mastacembelus armatus）进行简化基因组测序,开发二、三、四碱基重复类型的微卫星引物共105对（重复次数≥6）,其中可稳定扩增的引物有50对（47.6%）,通过多态性分析,发现有38个微卫星位点表现出多态性,从中随机选取三种重复类型微卫星各10对对北江群体进行遗传多样性分析,及各6对对澜沧江大刺鳅群体进行遗传多样性分析。结果显示,（1）在大刺鳅中二碱基重复微卫星位点筛选效率为50%,而三、四碱基重复的筛选效率分别为31.1%、35%。（2）北江群体的平均多态信息含量为0.649