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非编码RNA（ncRNA）在人类基因转录本数目中占比很高,研究表明它们能在许多关键的生物学过程中发挥重要作用。目前只有极少数ncRNA通过实验证明具有明确的功能,大量ncRNA的功能依然未知。通过预测ncRNA的靶RNA进而增加对ncRNA功能和工作机制的深入了解变得日益重要。本文介绍了多种预测ncRNA靶RNA的生物信息学方法,概述了各个方法的主要算法思想以及其优缺点。最后,在总结分析现有算法的基础上,探讨了该领域的进一步研究方向。