整合生物信息学鉴定与分析急性心肌梗死的特征基因及潜在中药预测(英文)

来源 :紫色刊名为“中国知网”个刊发行刊物 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ZYYZH
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
采用Gene Expression Omnibus (GEO)数据集联合机器学习研究急性心肌梗死(acute myocardial infarction, AMI)的差异基因, 并预测具有调控作用的潜在成分及中药。从GEO数据库下载AMI的人类全基因组数据集(GSE66360和GSE61145), 以GSE66360作为测试集, 通过R语言的normalize Between Arrays包进行校正后, 再调用limma包获取差异基因(DEGs), 对DEGs作Gene Ontology (GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)、Disease Ontology (DO)富集分析; 采用SVM及随机森林树法筛选特征基因, 利用GSE61145数据集对得出的特征基因进行验证; 通过CTD数据库找到AMI特征基因所对应的中药成分, 利用Coremine数据库映射中药成分所对应的中药, 并依据《中药大辞典》、《中华本草》、《中国药典》等对所得中药的频次、四气、五味、归经进行汇总。通过对GSE66360数据集进行分析, 得到317个差异基因, 其中306个上调, 11个下调, GO和KEGG富集分析显示AMI的差异基因主要涉及中性粒细胞介导的炎症和免疫反应、脂代谢异常、脂质和动脉粥样硬化相关通路等, DO富集分析表明差异基因与动脉硬化性心血管疾病、肺部疾患等密切相关。通过SVM及随机森林树法得到6个特征基因: ZFP36、GADD45A、PELI1、METRNL、MMP9、CXCL16。CTD映射到成分97种, Coremine数据库映射到中药824味, 经过汇总后发现治疗AMI的中药以甘、苦、温为主, 多归于脾、胃、肝经。经汇总后, 调控AMI的特征基因(ZFP36、GADD45A、PELI1、METRNL、MMP9、CXCL16)成分主要有Benzo(a)pyrene, Tetrachlorodibenzodioxin, Acetaminophen等, 中药有茶树根、郁金、人参等, 其性味为甘、苦、温, 归经多为脾、胃、肝经。
其他文献
后疫情时代,市场环境日趋复杂与动荡,企业经营危机频现,作为更加灵活且愈发普遍的组织形式,企业中的团队同样面临发展困境甚至生存挑战。团队韧性是一种应对多元逆境的理想特质,可以帮助团队抵御风险、走出逆境,甚至“转危为机”,实现更快更好的发展。然而,尽管在实践中团队韧性的重要性在不断提升,相关研究却仍处于起步阶段,尤其是对于领导力与团队韧性的关系缺乏系统而深入的研究。领导风格是影响员工与团队行为的重要前
砂土是典型的颗粒固体。颗粒固体在不同尺度下的行为具有不同的物理机制,但又存在着紧密关联。决定颗粒固体宏观力学性质的不仅仅是颗粒组成,还取决于颗粒间相互作用的细观结构。揭示颗粒固体宏观力学性质机理,需要了解颗粒固体的细观特征,还需要建立宏细观尺度的力学关联。但是,直接建立这种跨尺度关联是困难的。近年来,随着介尺度理论的研究深入和一些新兴测试技术的运用,使得固体颗粒和颗粒间细观结构特征能够得到更加精细
在英语音标教学中,大部分教师都是基于学生的模仿能力,让学生跟着教师模仿,忽视了许多发音细节,导致很多孩子的口语水平存在不足,而且还有一些教师枯燥无味地将音标讲给学生听,以此就使得孩子对音标学习失去了兴趣。基于此背景,本文以小学英语音标教学的有效教学策略研究为题展开讨论。
目的 通过中药方剂灌胃建立功能性消化不良(FD)大鼠模型,研究其小肠Cajal间质细胞(ICC)中凋亡相关蛋白Caspase-3蛋白及mRNA的表达,探讨Caspase-3在FD大鼠小肠ICC中的表达及意义。方法 选用80只SPF级的Wistar成年大鼠,雌雄各半,随机分为对照组(n=30)和FD模型组(n=50)。对照组大鼠生理盐水灌胃,FD模型组用中药方剂灌胃建立FD大鼠动物模型。喂养和造模过
自20世纪末以来,随着我国经济和社会的发展,科技影响了生活的方方面面。在公共视频监控系统领域,各类智能监控设备已随处可见,并逐渐成为了民众生活中不可或缺的一道安全屏障。然而,公共视频监控设备带来积极作用的同时,由于缺乏规制其使用的专项法规,致使公共视频监控系统侵犯个人隐私权事件时有发生,给公众的个人隐私权保护带来了威胁。因此,由公共视频监控与个人隐私权的矛盾所形成的公共安全与公民隐私之间的争议,在
我国的古生物化石资源丰富、分布广泛、种类众多,是当之无愧的的古生物化石大国,而古生物科普工作却任重道远。随着大众生活的需求侧重点发生变化,传统形式的古生物产品设计已满足不了人们消费过程中所追求美好感受的体验需求,进行文创产品开发的设计升级是传播古生物科学文化过程中的紧迫任务。多感官体验设计理念的引入,可以将冰冷遥远的古生物化石转化为富有生活气息的产品,实现消费者对于古生物文创产品的精神诉求,有利于
跨境电商的高速发展,离不开物流运输的支持与推动,因此还需要对不同跨境物流方案展开详细深入的分析,然后探讨其优点与问题,进而选择合适的物流方案。此外,还需要不断创新跨境电商的物流模式,针对其存在的问题提出切实可行的解决策略。
目的探讨壳聚糖(chitosan,CS)纳米粒作为甲型副伤寒沙门菌重组外膜蛋白NmpC和PagC的佐剂对小鼠的免疫效果。方法采用离子交联法将甲型副伤寒沙门菌重组外膜蛋白NmpC和PagC与CS结合制成CS纳米粒,扫描电镜观察纳米粒外观,激光粒度分析仪测定纳米粒粒径和多分散系数,BCA法测定其包封率。将CS纳米粒经肌肉注射免疫BALB/c小鼠,ELISA法检测小鼠血清特异性抗体IgG、IgG1和Ig
“校社协同”育人模式是政治学与行政学专业顺应应用型专业建设的政策导向、满足人才市场用人需求的现实考量以及提升专业核心竞争力的内在驱动所探索出的一种高校与街道、社区协同育人的创新模式。共同体的育人理念、科层化的育人场域、双导师制的育人师资、特色化的育人课程以及多元化的育人考核是推动该模式运行的核心要素。该模式在促进政治学与行政学应用型专业建设、缓解基层治理压力以及推动政务人才培养的供给侧与需求侧相衔