水稻稻瘟病抗性基因Pik-2的遗传变异及进化分析

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Pik位点是水稻第11染色体上稻瘟病抗性基因成簇分布的热点区域,对该位点抗性基因在水稻品种中多样性分布的研究,有助于揭示该基因的进化规律和进一步挖掘其等位基因。对来自不同国家和地区的400份非洲稻和400份亚洲稻稻种抗稻瘟病基因Pik-2编码区序列进行了测序分析,发现非洲稻和亚洲稻品种Pik-2编码区碱基变异非常丰富,非洲稻种中出现了113个变异位点,亚洲稻种中有78个碱基位点发生多样性变异,其中两者均在1879位点显示出极高的变异频率;根据其碱基变异特点,非洲稻种和亚洲稻种分别呈现出17和12种单倍型。
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