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器官特异性自身免疫性疾病的发生主要在于“自我免疫耐受”机制的破坏，机体免疫系统针对自身组织产生抗体和（或）致敏淋巴细胞，产生病理应答反应损伤表达相应抗原的组织器官。诸多因素参与破坏“自我耐受”机制，目前认为辅助性T淋巴细胞（Th）中的Th1／Th2细胞功能失调以及CD4^＋CD25^＋调节性T细胞（regulatory T cells，Tr）数量及调节活性的改变导致的自身免疫调节紊乱，是引起组织破坏和器官病变的主要原因。