【摘 要】
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民猪是我国优良地方猪品种,具有高繁殖、耐粗饲、抗逆和肉质优良等特性,但遗传背景模糊。为合理保护和利用民猪资源,利用Illumina Hiseq2000测序平台,采用双末端测序方法,测
【机 构】
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黑龙江省农业科学院畜牧研究所,农业农村部种养结合重点实验室
【基金项目】
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黑龙江省科技攻关项目(GC12B311);黑龙江省科研机构创新能力提升专项(YC2016D001);国家生猪产业技术体系项目(CARS-37)
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民猪是我国优良地方猪品种,具有高繁殖、耐粗饲、抗逆和肉质优良等特性,但遗传背景模糊。为合理保护和利用民猪资源,利用Illumina Hiseq2000测序平台,采用双末端测序方法,测定10头民猪和4头东北野猪全基因组序列,统计分析SNPs和InDel标记信息,利用NCBI数据库中已知的50个不同个体的SNPs信息作主成分分析并构建分子进化树,使用θπ和Fst两个参数筛选民猪和东北野猪基因组内受选择基因。结果表明,民猪基因组内检测8255874个SNPs,大量的SNPs发生在基因间区及内含子区;与猪dbSN
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