【摘 要】
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目的 通过生物信息学方法筛选良性前列腺增生(BPH)的关键基因和相关通路,探究BPH发生、发展可能的病理、生理机制.方法 利用基因表达汇编(GEO)数据库下载BPH与正常前列腺组织的两个芯片数据(GSE7307与GSE119195),通过Rstudio软件对数据集进行差异基因(DEGs)筛选及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析及可视化;运用Cytoscape软件中的ClueGO插件进行基因本体论(GO)富集分析与可视化.利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,在Cytosca
【机 构】
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430030 武汉, 华中科技大学同济医学院附属同济医院泌尿外科
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目的 通过生物信息学方法筛选良性前列腺增生(BPH)的关键基因和相关通路,探究BPH发生、发展可能的病理、生理机制.方法 利用基因表达汇编(GEO)数据库下载BPH与正常前列腺组织的两个芯片数据(GSE7307与GSE119195),通过Rstudio软件对数据集进行差异基因(DEGs)筛选及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析及可视化;运用Cytoscape软件中的ClueGO插件进行基因本体论(GO)富集分析与可视化.利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,在Cytoscape中可视化,并通过Cytoscape中的cytoHubba插件得到关键基因.通过NetworkAnalyst预测调控关键基因的转录因子和miRNA.结果 本分析共得到36个上调DEGs,45个下调DEGs.GO分析发现DEGs主要富集于干细胞负性增殖调控、乙醇初步代谢、维生素效应等生物学过程,KEGG主要富集于Hippo信号通路、PPAR信号通路、肾素分泌等信号通路;最终得到CCL2、LPL、VCAN、IGF1、WNT2这5个关键基因.结论 本研究通过生物信息学方法筛选获得可能参与BPH发生、发展的关键基因及其相关通路,为阐明BPH的发病机制提供了一定的理论基础.
其他文献
[目的]基于p62-核因子红细胞样2相关因子2(Nrf2)通路探讨黄芪甲苷(ASTⅣ)对抗小鼠淋巴细胞白血病耐药株的机制.[方法]复制白血病细胞耐药模型,将细胞分为6组,即空白组(blank)、模型组(model)、黄芪甲苷组(ASTⅣ)、盐酸维拉帕米(VER)、Nrf2通路抑制剂(ML385)组及抑制剂与黄芪甲苷组(ML385+ASTⅣ),药物干预48 h.细胞计数试剂盒-8(CCK-8)检测耐药细胞对顺铂的敏感性,流式细胞仪检测细胞内活性氧(ROS)变化,明确ASTⅣ对耐药细胞的影响;流式细胞仪检测细
[目的]观察通脉养心丸对阿霉素所致慢性心脏毒性大鼠保护作用.[方法]建立阿霉素诱导慢性心脏毒性大鼠模型,给予通脉养心丸干预,观察通脉养心丸对阿霉素诱导慢性心脏毒性大鼠的饮食量、日常状态、死亡率、心电图、心脏功能、心脏指数、血清心肌酶检测及心肌组织形态观察.[结果]与空白对照组相比,模型组及给药组大鼠体质量增长率较低,增长速度慢,死亡率上升,模型组大鼠一般情况较差,但给予通脉养心丸后,大鼠一般情况有所改善.第4周,与空白对照组相比,模型组呼吸频率(RR)间期显著延长、心率显著降低,与模型组相比,给药组RR间
[目的]研究荷叶碱对高尿酸血症小鼠的作用,筛选与高尿酸血症代谢有关的生物标志物.[方法]采用小鼠长期给药氧嗪酸钾模型,连续给药14 d后,运用核磁共振氢谱(1H-NMR)技术同时检测高尿酸血症小鼠的血浆和尿液样本.[结果]通过1H-NMR分析方法在血浆和尿液样品中共筛选出9个潜在生物标志物.[结论]荷叶碱对高尿酸血症小鼠的代谢组学研究表明高尿酸血症的病理过程主要涉及到酪氨酸代谢、柠檬酸代谢、精氨酸与脯氨酸代谢以及糖酵解和糖异生代谢途径,预示着这些潜在生物标志物不仅在早期疾病诊断中起重要作用,而且在预防高尿
前列腺癌(prostate cancer, PCa)是男性最常见的恶性实体肿瘤之一,根据GLOBOCAN癌症统计数据,2020年PCa已居于全球男性恶性肿瘤发病率第二位,死亡率第五位[1].自1990至2015年,全球PCa发病率已增加3.7倍[2].我国PCa发病率虽低于欧美发达国家,但近年来随着人口老龄化加剧等问题,PCa发病率持续上升[3].
正常人体的胃部菌群处于动态平衡状态,帮助维持着消化系统的功能,目前已知的胃部菌群的主要组成包括5大菌门及69个菌属.近年研究表明胃部菌群失衡与胃癌及癌前病变的发生发展有着密切关系,有效地修复胃部菌群的平衡对于防治癌变有着显著意义.中医药在防治胃癌及癌前病变方面有着较好的临床疗效,中医学以整体观念和辨证论治为疾病的防治原则,与微生态学提倡的平衡与协调理念相合,且中药通过口服进入消化道以后,可以直接和胃肠道的菌群起双向调节作用.希望能够从中药调节胃部菌群平衡的新视角切入,为中药防治胃癌及癌前病变研究提供新的思
目的 比较经腹膜后入路肾段动脉阻断的两种术式,即机器人辅助腹腔镜肾部分切除术(RAPN)和腹腔镜肾部分切除术(LPN)治疗T1期肾脏肿瘤的术后肾功能和围手术期结果.方法 收集2018年6月至2020年6月于我院行肾部分切除术的75例肾癌患者的临床资料,其中接受RAPN治疗的肾癌患者33例,接受LPN治疗的肾癌患者42例.回顾性分析两组患者在手术时间、热缺血时间、术中出血量、手术并发症、术后住院时间、手术前后肾小球滤过率(GFR)和肾脏体积等方面的差异.结果 RAPN组和LPN组均顺利完成手术,均未转化为开
目的 初步探究外周血中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)在新辅助化疗指导下肌层浸润性膀胱尿路上皮癌综合治疗中的意义.方法 回顾性分析中国医学科学院肿瘤医院行新辅助化疗的94例临床分期为T2～4aN0M0膀胱癌患者的临床资料,新辅助化疗方案采用吉西他滨+顺铂,21 d为1个周期,疗程3～4个周期.分析化疗前NLR高低与临床病理特征、新辅助化疗疗效及患者预后的关系.结果 94例患者中,影像学评估新辅助化疗客观缓解率为70.2％(66/94),单因素分析其疗效与患者的年龄、性别、组织学分级、肿瘤初发或复发、肿瘤数
帕金森病(PD)是一种常见的神经退行性运动障碍,在老年群体中高发.近年来,PD患者的数量在世界范围内迅速增加,但是病理机制仍然不明确,目前临床上常用的PD治疗药物左旋多巴胺,具有一定的不良反应.而药食同源类中药因为其低毒特性以及对PD的神经保护潜力而受到越来越多的关注.大量研究表明,某些药食同源类中药可以通过改善线粒体功能,减轻氧化应激和减少神经细胞凋亡发挥抗PD的作用.药食同源类中药可能是具有前景的抗PD药物,因此文章对PD常见的的实验模型、药食同源类中药的活性成分及其可能的治疗机制进行综述.
目的 探讨利用前列腺左右径、上下径计算前列腺特异性抗原新参数(PSA-A)对前列腺癌(PCa)的预测价值.方法 收集解放军联勤保障部队第九八○医院泌尿外科2018年6月至2020年12月行经直肠前列腺穿刺活检术患者的临床资料,包括年龄、超声测量前列腺体积(PV)的上下径、左右径、前后径、游离PSA(fPSA)、总PSA(tPSA).最终纳入tPSA 4.0～20.0 ng/ml的患者共426例.根据椭圆形面积评估法计算前列腺冠状面积S=π×(左右径/2)×(上下径/2),为计算简便,进一步校正公式为S=左
目的 了解城市社区居民对前列腺癌的认知水平及相关影响因素.方法 对深圳市福南社区年龄≥40岁男性居民发放问卷,对7个前列腺癌相关知识点(包括前列腺癌的基本定义、好发人群、人种和地域发病情况、与饮食相关性、早期症状、疾病转归)进行认知调查,并统计分析问卷结果.结果 785名居民参加了问卷调查,平均年龄57.4岁(40～90岁).受调查者对相关问题的知晓率:前列腺癌是一种恶性肿瘤(60.1％)、老年人发病率高(45.2％)、欧美男性最高发的癌症(4.5％)、城市发病率高于农村(4.7％)、与高脂饮食相关(4.