中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guigui1987
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的研究中国庚型肝炎患者分离的病毒基因的特异性及变异规律。方法应用逆转录-巢式聚合酶链反应(PCR)技术从16例庚型肝炎病毒(HGV)感染住院病人血清中扩增了HGVNS5区部分基因片段(141nt)。经纯化后采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果观察到在HGVNS5区第7820-7960核苷酸之间的5′端较3′端核苷酸及其编码氨基酸变异率高。与Linnen等报道的美国株HGV相比,中国人HGVNS5区核苷酸的变异主要集中在HGVNS5工第7824,7845~7860,7892,7914,7917和7935核苷酸位点及区域,各个核苷酸位点的变异率在0~89.5%,与美国株相比核苷酸序列的同源性为83.6%~95.7%,平均89.6%;氨基酸为83.0%~100%,平均为91.2%。在7933核苷酸位点与美国株相比变异率为93.7%。结论中国人群之间HGVNS5区部分基因及其推测编码蛋白较保守,但与美国株有明显差别。不同硷基在序列中呈散在分布,而在某些位点虽与美国株相比变异很大,但中国人群之间离散度较小,HGV核酸的变异可能与地域因素有关。 Objective To study the specificity and variation of viral genes isolated from patients with hepatitis G in China. Methods Reverse transcriptase-nested polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify a portion of HGVNS5 gene fragment (141 nt) from 16 inpatients with hepatitis G virus (HGV) infection. After purification, sequence analysis was performed by dideoxy chain termination. As a result, it was observed that the 5 ’end of the nucleotide between the 7820th and the 7960th nucleotide in the HGVNS5 region had a higher mutation rate than the 3’end nucleotide and its encoded amino acid. Compared with the American strain HGV reported by Linnen et al., The nucleotide variation in Chinese HGVNS5 region mainly concentrated at the nucleotide positions and regions of HGVNS5 workers 7824, 7845-7860, 7892, 7914, 7917 and 7935, The mutation rate of the acid sites ranged from 0 to 89.5%. The homology of the nucleotide sequences to the American strain was 83.6% ~ 95.7% with an average of 89.6% and the amino acid was 83.0% ~ 100%, with an average of 91.2%. The mutation rate was 93.7% in the 7933 nucleotide compared with that of the American strain. Conclusion Some Chinese HGVNS5 genes and their putative encoded proteins are more conservative than those from the U.S. strain. The different bases are scattered in the sequence, while in some loci, although they vary greatly from those in the American strain, the dispersion among Chinese populations is small. The variation of HGV nucleic acid may be related to the geographical factors.
其他文献
本刊讯 日前,首钢总公司工会召开学习贯彻中国工会十四大精神会议,首钢总公司工会系统的工会主席和部分工会干部70余人参加了会议。 Recently, the Shougang Corporation u
企业家是以企业资产增殖为经营目标。通过产权市场竞争过程将自己的知识财产(即人力资本)与企业的物质财产结合在一起,从而在经营中占有企业的整体资产,独立、创造性地组织
山东省总工会利用工会的组织网络优势,和保险经纪公司、承保公司合作,开办了“职工补充保险”,使广大职工又多了一道生存保障线。 Shandong Federation of Trade Unions us
《军队卫生装备检修管理办法》和《军队卫生装备检修机构业务建设验收暂行标准》自2000年正式颁布实施以来,在总后卫生部统一领导下,全军各级卫生装备检修机构以“三个代表”
加快企业家职业化与市场化的过程,已成为我国经济改革中一项十分紧迫的任务。在我国,一个能人救活一个企业,一个庸人贻误一个企业,厂长经理的素质、能力和业绩问题显得至关
由于“非法出版物《大陆首骗牟其中》”在全国各地的迅速传播,“牟其中——首富还是首骗”的争议目前已成为国内外媒体竞相报道的热点新闻。不少读者来信,对本刊上期视点《“
目的:了解通辽铁路分局地区病毒性肝炎的发病与流行趋势。方法:采用常规的流行病学统计分析方法。结果:通辽铁路分局地区病毒性肝炎以甲型肝炎和乙型炎发病率高,且多为青少年。结
上海希望私营经济城,一个隶属上海市级嘉定工业区、古地仅2000亩的综合开发小区,在1993年7月成立至今的短短数年当中,《人民日报》以连载的篇幅予以报道、《解放日报》辟出版