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【目的】明确云南省金线莲种植基地金线莲灰霉病病原菌。【方法】采用组织分离法对病原菌进行分离纯化,并完成柯赫氏法则验证。根据病原菌的形态特征、rDNA-ITS和RPB2基因序列明确病菌种类。【结果】从发病组织分离获得纯培养病原真菌C2L2能导致金线莲发生灰霉病;根据形态特征与分子系统进化分析,将该病原菌确定为灰葡萄孢(Botrytis cinerea)。【结论】本研究为金线莲病害研究与防控提供参考依据。