【摘 要】
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目的 通过构建骨骼肌中环状RNA (circular RNA,circRNA)表达谱,筛选出人体骨骼肌中与死亡时间具有时序性变化的circRNAs,并对筛选出的circRNAs进行验证,进而探讨其相对表达量与死亡时间的相关性.方法 芯片实验选取2例外界温度、湿度相对一致,已知死亡时间在24h内的个体,分别于尸检即刻(12h以内)、3、5、7、10d各取50g组织进行总RNA提取,并进行逆转录、探针标记、基因芯片检测等实验,初步得到circRNA表达谱;对筛选出的circRNAs在后续收集的18例检材中进行
【机 构】
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济宁医学院法医学与医学检验学院,山东济宁272067
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目的 通过构建骨骼肌中环状RNA (circular RNA,circRNA)表达谱,筛选出人体骨骼肌中与死亡时间具有时序性变化的circRNAs,并对筛选出的circRNAs进行验证,进而探讨其相对表达量与死亡时间的相关性.方法 芯片实验选取2例外界温度、湿度相对一致,已知死亡时间在24h内的个体,分别于尸检即刻(12h以内)、3、5、7、10d各取50g组织进行总RNA提取,并进行逆转录、探针标记、基因芯片检测等实验,初步得到circRNA表达谱;对筛选出的circRNAs在后续收集的18例检材中进行验证,对所得数据进行统计分析.结果 骨骼肌组织中共检测出13156个circRNAs,但在10d内整体呈下降趋势的circRNAs只有hsa_ circ_ 0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_ circ_ 0005251、hsa_ circ _0000284、hsa_ circ_ 0000520、hsa_circ_00019717个.对所筛选出的7个circRNAs在18例检材中进行验证,发现只有hsa_ circ_ 0001727、hsa_ circ__ 0001136、hsa_ circ_ 0001871、hsa_circ_0005251、hsa_ circ_00002845个circRNAs随着死亡时间增加,其相对表达量显著下降,具有统计学意义(P＜0.05).而hsa_ circ_ 0000520、hsa _circ_ 00019712个circRNAs的表达为阴性.结论 circRNA是一种较为稳定的生物标记物,部分可用于死亡时间推断的研究.
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