【摘 要】
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探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点,揭示其分子水平上的进化选择模式,并与cytb进行了比较.采用测序法,获得鹿科6属动物dra第二外显子2
【机 构】
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圈养野生动物技术北京市重点实验室北京动物园,国家林业局调查规划设计院,北京麋鹿生态实验中心
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探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点,揭示其分子水平上的进化选择模式,并与cytb进行了比较.采用测序法,获得鹿科6属动物dra第二外显子246 bp的序列.研究结果表明,多态性位点数18个,独立变异位点13个.mhc-dra第二外显子显示出较低的核苷酸变异,且6属有各自独特的变异位点.氨基酸序列中抗原结合位点共计20个.其中,鹿科6属动物的氨基酸位点63,驼鹿属氨基酸位点18,是不同于马属和人属的抗原结合位点,推测鹿科动物可能有着不同的抗原结合模式.根据非同义替代率(Ka)和同义替代率(Ks)比值的计算结果,表明鹿属mhc-dra第二外显子为正向选择,其余5属均为纯化选择.对mhc-dra第二外显子及cytb分别运用邻接法(NJ),最大似然法(ML)和贝叶斯推论(BI)进行系统发育重建得到相似结果,形成了旧世界鹿类与新世界鹿类的姐妹类群.麂亚科cytb和mhc-dra第二外显子的基因型可能是鹿亚科与其它亚科之间的过渡型,而气候变化和环境变迁可能是推动mhc-dra第二外显子分化的潜在原因.
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