功能性单核苷酸多态性调控结核病易感的分子机制研究

来源 :中国防痨杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ycdyjlc
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目的 通过构建花生四烯酸12-脂氧合酶(ALOX-12)基因(ALOX-12基因)启动子区域rs3840880位点不同基因型的双荧光素酶表达质粒,分析此单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)对ALOX-12基因启动子活性的影响及其对基因表达的影响,阐明功能性SNP调控结核病易感的分子机制.方法 从全血样本中提取人全基因组,PCR扩增ALOX-12基因启动子区域包含rs3840880位点在内的约1700 bp的基因片段,构建pGL3-Basic-rs3840880G质粒,对此质粒进行定点突变得到pGL3-Basic-rs3840880 D放散型(DEL)质粒,分别转染人宫颈癌细胞株Hela细胞后使用双荧光报告酶检测系统(dual luciferase assay system)检测相对荧光值.结果 成功构建了ALOX-12基因启动子区rs3840880位点等位基因G的表达质粒pGL3-basic-G,采用定点突变技术成功将pGL3-basic-G质粒改造为pGL3-Basic-DEL质粒,测序验证后,两质粒其他序列完全相同.分别将此两个质粒转染Hela细胞并检测相对荧光比值[荧光值(F)/荧光?]后,发现pGL3-Basic质粒F/R=0.129,等位基因G的F/R=0.194,低于等位基因DEL质粒的F/R(0.274),采用单因素方差分析,二者之间的差异有统计学意义(F=25.09,P=0.001).结论 不同等位基因构建的质粒转染细胞后,荧光报告基因的表达差异具有统计学意义,故ALOX-12基因启动子区域的功能性SNPs确实能够影响启动子的活性,从而调控结核病的易感性.“,”Objective To construct different genotype dual luciferase expression plasmid expressed the rs3840880 loci of promoter region located in arachidonic acid lipoxidase-12 (ALOX-12) gene, and to analyze the effects of this single nucleotide polymorphisms (SNP) on ALOX-12 gene promoter activity and gene expression, in order to elucidate the molecular mechanism of functional SNP regulated tuberculosis susceptibility.Methods The 1700 bp fragments contained rs2840880 loci of promoter region located in ALOX-12 gene were amplified with human genome DNA extracted from whole blood samples by PCR.The pGL3-Basic-rs3840880 DEL plasmids was obtained from pGL3-Basic plasmid constructed with the PCR products and the original plasmid by site-directed mutagenesis and transfected into human cervical carcinoma cell line(Hela).The relative fluorescence values were detected by the dual luciferase assay system.Results The pGL3-Basic-DEL plasmid from pGL3-Basic-G plasmid containing the rs3840880 loci of promoter region located in the ALOX-12 gene by site-directed mutagenesis was obtained and sequenced successfully.The relative fluorescence ratio (F/R) were detected after two plasmids were transfected into Hela cell line.The fluorescence ratio of allele G (F/R=0.194) was lower than that of allele DEL (F/R=0.274), pGL3-Basic (F/R=0.129) with significant difference statistically (F=25.09,P=0.001).Conclusion The expression differences of fluorescence reporter gene in the plasmids constructed with different alleles and transfected into Hela cell line are significant statistically.It shows that functional SNP of ALOX-12 gene affect really the activity of promoter and regulate tuberculosis susceptibility.
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