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本文叙述了16世纪中叶至17世纪中叶日本长崎城市崛起、发展、演变的历史,分析了日本的基督教大名、幕府、耶稣会和葡萄牙殖民者在宗教和贸易上相互之间的复杂联系及其与长崎城市的共生关系;同时也叙述了作为幕府在长崎的行政长官长崎奉行的职权范围、长崎城市的葡萄牙人居留地的模式、长崎的葡萄牙人和日本基督徒的宗教与社会生活、长崎与澳门在宗教和贸易的密切联系、德川幕府的禁教政策的演变及其最后下决心严禁长崎与葡萄牙人贸易的原因.