【摘 要】
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目的 对1株分离自重症肺炎患者痰液标本的铜绿假单胞菌噬菌体进行基因组生物信息学分析,以期了解该噬菌体与致病菌的关系及生物学特性,为铜绿假单胞菌感染所致疾病的治疗提供
【机 构】
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新疆医科大学基础医学院,新疆乌鲁木齐830011;新疆医科大学第六附属医院;楚雄医药高等专科学校检验系
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目的 对1株分离自重症肺炎患者痰液标本的铜绿假单胞菌噬菌体进行基因组生物信息学分析,以期了解该噬菌体与致病菌的关系及生物学特性,为铜绿假单胞菌感染所致疾病的治疗提供新思路和新方法. 方法 收集铜绿假单胞菌感染导致的1例重症肺炎患者的痰液标本,利用双层平板法进行噬菌体的分离纯化,纯化后的噬菌体进行最佳感染复数(MOI)测定.用PEG 8 000沉淀噬菌体粗颗粒,加2％磷钨酸负染后用透射电镜观察其形态;提取噬菌体DNA,进行序列测定和生物信息学分析. 结果 分离出1株铜绿假单胞菌噬菌体(zjk6),其效价为2.01×109 PFU,MOI指数为0.1.电镜观察该噬菌体为长约188 nm、宽约56 nm的蝌蚪状肌尾噬菌体.其基因组总长度为41 186 bp,GC含量为61.89％.该噬菌体基因组注释共得到62个开放阅读框架(ORF),得到61个预测蛋白.在注释的58个相似蛋白中有32个蛋白相似度超过50％,其中15个假设蛋白,17个为可体现噬菌体功能和结构的重要蛋白. 结论 该例铜绿假单胞菌肺炎患者痰液标本中分离获得的铜绿假单胞菌噬菌体是一种具有裂解性的肌尾噬菌体,其基因组编码多种可能与功能和结构有关的重要蛋白,可作为铜绿假单胞菌引起的感染性疾病治疗的备选生物制剂.
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