【摘 要】
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基因组测序技术的发展为我们提供了研究家畜重要经济性状遗传基础的契机。家畜和人类医学中的全基因组关联分析表明单个数量性状基因座(QTL)的效应是非常微小的。这一结论促
【机 构】
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河套学院农学系; 爱荷华州立大学动物科学系; 河套学院土木工程系;
【基金项目】
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国家自然科学基金(项目批准号:31460594);河套学院教学研究项目(项目批准号:HTXYJZ14005);国家留学基金委项目(项目批准号:201308155140)共同资助
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基因组测序技术的发展为我们提供了研究家畜重要经济性状遗传基础的契机。家畜和人类医学中的全基因组关联分析表明单个数量性状基因座(QTL)的效应是非常微小的。这一结论促使利用高密度单核苷酸多态性(SNP)信息进行基因组选择方法的研究。结合新的统计学方法,并检测基因组数据的特征无疑是进行基因组研究和实验设计的基础。准确的掌握基因组数据的特征可以为QTL检测和研究数量性状的遗传基础提供坚实的研究基础。但是,海量的基因组数据量加大了研究基因组数据特征的难度。本文中,我们讨论了研究基因组时代动物育种研究中基因组数据基本特征及其必要的统计学基础。此外,我们还提供了分析基因组特征的简单示例和Julia语言代码。在此基础上,我们讨论了在全基因组测序数据和系统分析等情况下,基因组数据基本特征分析所面临的挑战。
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