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测定了两种转基因抗虫棉(Gossypium hirsutumL.)材料的Bt基因表达盒序列,其在Bt基因和Bt基因与终止子连接区的序列存在差异,而在启动子与Bt基因连接区的序列完全一致。基于这种Bt基因表达盒的差异,设计了3条引物MG-P1、MG-P2和MG-P3,建立了同时检测两种不同Bt基因表达盒的双重PCR方法。采用建立的方法,检测了40个转基因棉花材料,其中,只具有其中一种Bt基因表达盒结构的样品数为38个,同时具有两个表达盒结构的样品数为2个。