为了探究新疆野苹果无性系表型性状和生理指标的遗传多样性及其变异规律,全面系统对其种质资源进行评价,筛选出具有优良性状的无性系,以18个新疆野苹果无性系为研究对象,对其形态指标和生理指标进行方差分析、相关性分析、聚类分析以及主成分分析.结果 表明,18个新疆野苹果无性系在10个形态指标上均存在显著差异.各形态指标变异系数的变化范围为2.19％～15.91％,其中,南北冠幅的变异系数(15.91％)最大,叶面积的变异系数(2.19％)最小;各无性系树高和地径之间存在极显著正相关关系,相关系数为0.942.除叶绿素a外,18个新疆野苹果无性系在其他9个叶片生理指标上均存在显著差异,各生理指标变异系数的变化范围为2.04％～13.58％,其中,叶绿素b的变异系数(13.58％)最大,L*的变异系数(2.04％)最小;各无性系叶片色度参数a*值与花青素含量之间存在极显著正相关关系,相关系数为0.820.18个新疆野苹果无性系遗传距离的变化范围为3.230～9.075,平均遗传距离为5.089;在遗传距离为6.016处,18个新疆野苹果无性系被分为5类.18个新疆野苹果无性系的10个形态指标和10个生理指标被分为5个主成分,各主成分的贡献率在5.165％～32.910％,累计贡献率达到84.191％.M12得分最高,为0.975;M16得分最低,为-0.865.