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为揭示铁皮石斛不同器官中内生细菌的分布规律,应用Illumina测序平台的MeSiq高通量测序仪对铁皮石斛根、茎、叶中内生细菌的16S rDNA-V4区扩增子进行测序，对测得数据进行生物信息学分析，评价物种Alpha多样性和Beta多样性。经FLASH软件对序列进行拼接，茎、叶、根样品分别获得64 851、77 499、52 157条原始序列，经Qiime软件过滤，再剔除宿主的叶绿体和线粒体序列，最终分别得到64 742、77 351、52 064条有效序列，在97%的序列相似性水平上，这些有效序列被Up