用ID—SVM预测蛋白质的ATP结合位点

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kxdn01
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
从蛋白质序列出发,对经Dr.G.P.S.Raghava整理和使用过的168条非冗余的ATP与蛋白质结合氨基酸序列进行分段,对ATP与蛋白质结合位点进行了统计分析。在此基础上,利用20种氨基酸的亲疏水性将20种氨基酸约化为6类。以氨基酸组分和6类亲疏水紧邻为参数,用多样性增量(ID)方法将氨基酸组分和6类亲疏水紧邻降维并将降维后的特征参数输入支持向量机中运算,本文运算结果显示用氨基酸组分ID值和6类亲疏水紧邻ID值共同作为特征参数结果最优,在七交叉检验下的预测总精度达到了99.67%,相关系数达到0.993
其他文献
基于鲁棒优化理论的机组组合问题存在解的保守性较大,计算过程复杂等缺点。该文基于改进轻鲁棒模型,建立了新型的风–火电机组组合新模型,并推导出其混合整数线性规划(mixed
由于设备的工作环境和负载情况比较恶劣,在使用过程中电机温升有时会很严重,如果不加温度过高保护会使电机受损。本文针对单位现有机械装备特点,根据电机定子线圈电阻与线圈
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
都铎王朝处于英国向现代化转型的过渡时期,也处于封建制度向资本主义制度的转型时期。自亨利八世至伊丽莎白一世时期都进行了自上而下的宗教改革运动,在宗教改革的过程中,玛
目的:了解农村留守初中生的自杀态度及影响因素,为留守儿童自杀行为的预防、教育提供依据。方法:采用整群随机抽样方法,选择甘肃省4个县8所中学初一至初三的1032名学生进行自杀态
环境浓度水平下双酚A(BPA)暴露对生物体的毒性效应受到广泛关注。以早期发育阶段斑马鱼为模型,评价了环境浓度下BPA暴露对斑马鱼幼鱼运动行为的影响,并探讨了可能的作用机制。
“这是一条无尽的路。”刚上路的我常的这样想。  我正处在一个混沌的世界,天地总是融为一体。这里没有太阳,没有树木,也没有行人。仿佛我便是这个世界中唯一的生命。在我眼前只有一条路,一条不知通向何方的神奇的路。  開始的路很平坦,既无绊脚的石子,也无坑坑洼洼的泥沟,有的只是一条清晰的路。我要做的很简单,只是低着头,不知疲倦的走着。此时风和日丽,清风漾起。我听到了鸟鸣,嗅着不知名的花香,一切都是如此的慵
期刊
目的:了解新疆生产建设兵团护理人员生存质量状况,探讨影响护理人员生存质量的因素,为制定相应策略提供依据。方法:本次调查为横断面现况调查,用自行设计的“护理人员基本情