烟草SHMT基因家族鉴定与非生物胁迫诱导表达分析

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丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase, SHMT)是一种磷酸吡哆醛依赖酶,在植物一碳代谢途径、光呼吸和非生物胁迫过程中有着重要作用。为挖掘参与烟草抗逆胁迫的SHMT基因家族成员,本研究从烟草基因组中共鉴定到16个SHMT基因,命名为NtSHMT 1-NtSHMT 16。系统进化分析发现,NtSHMT基因家族成员可划分为4个亚家族,分别为Group I、II、III和IV。基因结构和蛋白保守基序分析表明,同一亚家族内成员在进化上具有较高的保守性。启动子分析发现,大部分NtSHMT成员的启动子区域包含ABA (Abscisic acid)、JA (Jasmonic acid)等激素诱导元件和与胁迫响应相关的顺式作用元件。表达模式分析发现,NtSHMT基因表达具有明显的组织特异性,在干旱、盐和冷胁迫处理下,有10个NtSHMT基因受干旱胁迫诱导表达,有4个NtSHMT基因受盐胁迫诱导表达,有2个NtSHMT基因受冷胁迫诱导表达。上述研究表明NtSHMT基因家族成员在非生物胁迫响应中起到重要作用。
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