【摘 要】
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为明确羊肚菌转录组SSR总体特征、开发出适用于分子育种的SSR引物,对分离自青海大通的小海绵羊肚菌M12-10菌丝体高通量转录组测序,采用MISA分析小海绵羊肚菌M12-10转录组SSR
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31560028);青海省科学技术厅项目(2018-ZJ-915)
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为明确羊肚菌转录组SSR总体特征、开发出适用于分子育种的SSR引物,对分离自青海大通的小海绵羊肚菌M12-10菌丝体高通量转录组测序,采用MISA分析小海绵羊肚菌M12-10转录组SSR位点信息,利用Primer 3.0设计引物,并选择12对引物将19株不同种、不同采集地的野生羊肚菌进行聚类分析。结果表明:高通量测序组装得到153326个转录本,100672个SSR位点分布在20043条Unigenes基因上;SSR发生频率为19.9%,单核苷酸(9268,46.0%)和三核苷酸(5183,25.0%)是
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