小麦品种抗病相关分子标记检测研究

来源 :山东农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zkl_2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  摘要:利用分子标记选育抗病小麦新品种已经成为一种快速有效的育种方法。本研究用29对抗病分子标记对354个小麦品种进行检测,分析这些标记在小麦品种中的分布情况。结果显示,检测到多个小麦品种同时含有多个标记,如黑麦AR132同时含有抗白粉病、叶锈病、纹枯病标记;淮麦0607、SN086218、石新733、徐30、潍74987、周麦28、中麦1219、连05167、淮05155、Jagger、CP02-62-1-2-2-2-1、中育01089同时含有抗白粉病、叶锈病、赤霉病标记。本研究为小麦聚合育种提供了一定依据。
  关键词:小麦;抗病性;分子标记检测;分子标记辅助育种;聚合育种
  中图分类号:S512.103.53文献标识号:A文章编号:1001-4942(2017)02-0001-09
  DNA 分子标记技术产生于20世纪70年代,是一种理想的、基于DNA 变异的新型遗传标记,它能反映生物个体或种群基因组中的差异特征[1]。分子标记突破了表达基因的范围而不受基因表达的影响,可在任何组织、任何发育阶段进行检测。DNA 分子标记的开发和应用为建立分子标记辅助选择的农作物育种体系打开一扇新大门。目前,分子标记辅助育种技术(marker-assisted selection,MAS)在作物遗传育种上的应用越来越广泛,分子标记聚合育种得到很大发展,尤其是分子标记技术与常规育种的紧密结合,为作物育种技术带来一场新的变革。
  小麦是我国重要的粮食作物,利用MAS选育高抗小麦品种也已如火如荼地開展起来。到目前为止,已经发现了58个小麦抗白粉病基因[2,3]、90个抗叶锈病基因[4]、100多个抗条锈病基因[5]、52个赤霉病抗性相关QTL[6]、15个抗纹枯病分子标记[7]、1个抗黄矮病基因Bdv2[8]。董建力等[9]通过聚合杂交将3个小麦抗白粉病标记Pm4b、Pm13和Pm21聚合在一起,从F3代群体中筛选出同时含有2~3个标记的株系。王心宇等[10]采用早代进行抗性鉴定结合MAS策略,筛选到14株Pm4a+Pm21的植株,16株Pm2+Pm4a的植株,6株Pm8+Pm21的植株,其后代的抗病性明显提高。曾祥艳等[11]利用MAS选育出兼抗黄矮病、白粉病和条锈病的小麦新种质。这些研究为培育持久、广谱抗病小麦品种奠定了基础。
  然而迄今为止,研究者们对中国小麦品种遗传背景的了解仍不全面,每个小麦品种中含有多少个抗性分子标记,至今未做大规模系统调查。本研究检测了354份常规小麦品种的抗病相关分子标记,旨在为抗性小麦品种选育提供一定参考。
  1材料与方法
  1.1试验材料
  本实验室共计保存近600份小麦品种资源,选取其中的354份常规小麦品种进行抗病相关分子标记检测。
  1.2试验方法
  1.2.1取材每个小麦品种随机取10粒种子进行萌发,萌发10天时,每株取顶叶混合研磨用于提取基因组DNA。
  1.2.2基因组DNA提取采用CTAB法提取各材料基因组DNA[12]。用核酸仪测定DNA浓度,并稀释到50~60 ng/μL用于PCR扩增。
  1.2.3引物合成根据文献报道的小麦抗病基因引物序列(表1),由生工生物工程(上海)股份有限公司进行引物合成。
  1.2.4PCR扩增PCR反应体系:总体积20.0 μL,其中含有2×PCR Mix(百泰克)10.0 μL,上下游引物各1.0 μL,DNA模板1.0 μL,ddH2O 7.0 μL。
  PCR反应条件为:94℃预变性5 min;94℃变性1.0 min,退火0.5 min(退火温度根据各引物退火温度而定),72℃延伸0.5~1.0 min(根据各引物扩增片段长度而定),共35个循环;72℃终延伸10 min。扩增产物用相应浓度聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳检测,EB染色,紫外凝胶成像仪观察、拍照。
  2结果与分析
  2.1抗白粉病分子标记检测结果
  利用13对抗白粉病分子标记对354个小麦品种进行检测,结果如表2所示。其中引物Xcfd81-5DF/Xcfd81-5DR(图1A)、Xgwm159-5BF/Xgwm159-5BR、LAG95+1F/LAG95+2R、Xgwm337F/Xgwm337R检测的小麦品种较多,其检出数量分别占所检品种总数的51.1%、50.3%、40.7%、40.7%。并且这些标记之间具有一定的关联,83个小麦品种均同时含有这四个标记;142个品种同时含有标记Xcfd81-5DF/Xcfd81-5DR、Xgwm159-5BF/Xgwm159-5BR、Xgwm337F/Xgwm337R;99个品种同时含有标记Xcfd81-5DF/Xcfd81-5DR、Xgwm159-5BF/Xgwm159-5BR、LAG95+1F/LAG95+2R;177个品种同时含有标记Xcfd81-5DF/Xcfd81-5DR和Xgwm159-5BF/Xgwm159-5BR。
  Pm4bF/Pm4bR能够在38个小麦品种中扩增出目的条带(475 bp)(图1B),占所有检查品种的10.7%。C1F/R1R能够在44个小麦品种中检测出目的条带(470 bp)(图1C),占所有检查品种的 12.4%。BCD135-1F/BCD135-1R、BCD135-2F/BCD135-2R二对引物未在任何品种中检测出目的条带。
  3讨论与结论
  随着分子生物学的发展,利用MAS将是未来抗性小麦品种培育的方向。因此全面了解各个小麦品种至少是小麦核心种质分子水平的遗传背景是必不可少的,因为只有这样才能做到有的放矢地配制多种杂交组合,将多个抗性基因聚合到一起,培育多抗小麦品种。但是目前国内有关这方面的研究报道还不多。本研究用13对抗白粉病分子标记、7对抗叶锈病分子标记、2对抗条锈病分子标记、4对抗赤霉病分子标记、2对抗纹枯病分子标记、1对抗黄矮病分子标记对354个小麦品种的抗性背景在分子层面进行检测,检测到多个小麦品种同时含有多个标记,如黑麦AR132同时含有抗白粉病、叶锈病、纹枯病基因;淮麦0607、SN086218、石新733、徐30、潍74987、周麦28、中麦1219、连05167、淮05155、Jagger、CP02-62-1-2-2-2-1、中育01089同时含有抗白粉病、叶锈病、赤霉病基因。   孙果忠[43]用Pm4a/bF/Pm4a/bR检测了75个小麦品种,其中4个品种含有此标记,占5%。本试验检出4%的小麦品种含有此标记,二者基本相符。胡娜[44]用Pm2、Pm4、Pm13、Pm21、Pm30、Pm34分子标记对260份小麦育种亲本材料进行多态性检测,其中149份材料含有Pm2单基因(占57.31%),这与本研究结论相符(51.1%),可见Pm2标记在小麦中广泛存在。魏新燕等[36]对150个小麦品种的抗叶锈基因Lr35进行分子检测,检测出 8 个小麦品种(6068、白蚰包、中麦9、早洋、碧玛1号、小偃7631、东方红3号和 Madsen)含有Lr35标记,检出率较低,本研究在354个小麦品种中仅检出周麦20含有该标记,检出率也相当低。
  利用分子标记选育小麦新品种具有诸多优势,但是随着时间的推移,一些生理小种出现了变异导致部分标记失效。孙果忠[43]对101个分子标记的实用性进行了评价,发现可用于MAS的标记有51个,占供试标记的50.5%,此类标记可直接用于MAS育种;28个标记丧失了有效性,不能再用于MAS育种。雷秀玉[45]对145个主推小麦品种进行了苗期白粉病抗性鉴定以及小麦抗白粉病基因分子标记的实用性评价,结果表明,Pm8基因在145个供试品种(系)中的分布频率为52.4%,但对白粉病菌群体已丧失抗性;Pm2、Pm4、Pm6、Pm12、Pm13、Pm16、Pm17、Pm21和Pm24基因对白粉病菌群体抗性好,但在145個供试品种中的分布频率较低,介于0~9.7%。研究表明,将多个抗病基因聚合在一起可以显著提高品种抗病性。董建力等[9]通过复合杂交将抗小麦白粉病基因Pm4b、Pm13、Pm21聚合到推广品种。王心宇发现聚合Pm2+Pm4a、Pm4a+Pm21、Pm8+Pm21的后代植株抗性增强[10]。全面系统地调查不同小麦品种中含有的抗病分子标记,对于小麦聚合育种具有重大意义。
  参考文献:
  [1]周延清. DNA 分子标记技术在植物研究中的应用[M]. 北京:化学工业出版社, 2005:61-87.
  [2]宋伟. 分子标记辅助选择小麦抗白粉病兼抗赤霉病聚合体[D]. 雅安:四川农业大学, 2010.
  [3]王心宇. 分子标记技术在小麦抗白粉病育种及指纹图谱分析中的应用研究[D]. 南京:南京农业大学,2000.
  [4]周悦. 中国小麦品种中抗叶锈病基因的基因定位和等位检测[D]. 保定:河北农业大学,2012.
  [5]路妍. 三个小麦种质抗条锈病基因的遗传分析和HTAP抗病性基因Yr62的分子作图[D]. 杨凌:西北农林科技大学, 2014.
  [6]Buerstmayr H, Ban T, Anderson J A. QTL mapping and marker-assisted selection for Fusarium head blight resistance in wheat: a review[J]. Plant Breeding, 2009, 28(1):1-26.
  [7]姚金保, 姚国才, 杨学明, 等. 中国小麦抗纹枯病育种研究进展[J]. 江苏农业学报, 2007, 23(3):248-251.
  [8]高兰英. 小麦外源抗黄矮病基因Bdv2的标记开发及对突变体的鉴定[D]. 呼和浩特:内蒙古农业大学, 2009.
  [9]董建力, 张增艳, 王敬东, 等. 3 种小麦抗白粉病基因聚合体的 STS 和 SCAR 标记[J]. 西北农业学报, 2007, 16(3): 64-67.
  [10]王心宇, 陈佩度, 张守忠. 小麦白粉病抗性基因的聚合及其分子标记辅助选择[J]. 遗传学报, 2001, 28(7):640-646.
  [11]曾祥艳, 张增艳, 杜丽璞, 等. 分子标记辅助选育兼抗白粉病、条锈病、黄矮病小麦新种质[J].中国农业科学, 2005, 38(12):2380-2386.
  [12]王敏, 那冬晨, 姬虎太, 等. 快速小量提取小麦叶片DNA的一种简易方法[J]. 农业科学与技术(英文版),2009, 37(5):34-35.
  [13]Qiu Y C, Sun X L, Zhou R H, et al. Identification of microsatellite markers linked to powdery mildew resistance gene Pm2 in wheat[J]. Cereal Rersearch Communications, 2006, 34(6):1267-1273.
  [14]陈松柏, 蔡林, 周采平, 等. 小麦抗白粉病基因Pm4的STS标记[J]. 西南农业大学学报, 2002, 24(3):231-234.
  [15]Ma Z Q, Wei J B, Cheng S H. PCR-based markers for the powdery mildew resistance gene Pm4a in wheat[J]. TAG, 2004, 109:140-145.
  [16]Ji J H, Qin B, Wang H Y, et al. STS markers for powdery mildew resistance gene fmd in wheat[J]. Euphytica, 2008, 163:159-165.
  [17]Song W, Xie H, Liu Q, et al. Molecular identification of Pm12-carrying introgression lines in wheat using genomic and EST-SSR markers[J]. Euphytica, 2007, 158:95-102.   [18]Cenci A, D′Ovidio R, Tanzarella O A, et al. Identification of molecular markers linked to Pm13, an Aegilops longissima gene conferring resistance to powdery mildew in wheat[J]. TAG, 1999, 98:448-454.
  [19]Chen X M, Luo Y H, Xia X C, et al. Chromosomal location of powdery mildew resistance gene Pm16 in wheat using SSR marker analysis[J]. Plant Breeding, 2005, 124:225-228.
  [20]Mohler V, Hsaml L K, Zeller F J, et al. An STS marker distinguishing the rye-derived powdery mildew resistance alleles at the Pm8/Pm17 locus of common wheat[J]. Plant Breeding, 2001, 120:448-450.
  [21]Liu Z Y, Sun Q X, Ni Z F, et al. Development of SCAR markers linked to the Pm21 gene conferring resistance to powdery mildew in common wheat[J]. Plant Breeding, 1999, 118:215-219.
  [22]Huang X Q, Hsam S L K, Zeller F J, et al. Molecular mapping of the wheat powdery mildew resistance gene Pm24 and marker validation for molecular breeding[J]. TAG, 2000, 101:407-414.
  [23]Peng J H, Fahima T, Roeder M S, et al. High-density molecular map of chromosome region harboring stripe-rust resistance genes YrH52 and Yr15 derived from wild emmer wheat, Triticum dicoccoides[J]. Genetica, 2000, 109(3):199-210.
  [24]Wang C M, Zhang Y, Han D J, et al. SSR and STS markers for wheat stripe rust resistance gene Yr26[J]. Euphytica, 2008, 159(3):359-366.
  [25]Prins R, Groenewald J Z, Marais G F, et al. AFLP and STS tagging of Lr19, a gene conferring resistance to leaf rust in wheat[J]. TAG, 2001,103:618-624.
  [26]楊文香. Lr37、Lr44的AFLP分子标记及124个小麦品种(系)抗叶锈基因鉴定[D]. 保定:河北农业大学, 2003.
  [27]陈云芳, 刘莉, 杨文香, 等. 33个小麦品种(系)抗叶锈基因Lr19分子检测[J]. 分子植物育种, 2008, 6(5):1015-1018.
  [28]Dedryver F, Jubier M F, Thouverin J, et al. Molecular markers linked to leaf rust resistance gene Lr24 in different wheat cultivars[J]. Genome, 1996, 39:830-835.
  [29]Schachermayr G, Messmer M M, Feuillet C, et al. Identification of molecular markers linked to the Agropyron elongatum-derived leaf rust resistance gene Lr24 in wheat[J]. TAG, 1995, 90:982-990.
  [30]张娜, 陈玉碎, 李亚卞, 等. 小麦抗叶锈病基因Lr24的一个新STS标记[J]. 作物学报, 2008, 34(2):212-216.
  [31]杨文雄, 杨芳萍, 梁丹, 等. 中国小麦育成品种和农家种中慢锈基因Lr34/Yr18的分子检测[J]. 作物学报, 2008,34(7):1109-1113.
  [32]Lagudah E S, McFadden H, Singh R P, et al. Molecular genetic characterization of the Lr34/Yr18 slow rusting resistance gene region in wheat[J]. TAG, 2006, 114:21-30.
  [33]Bossolini E, Krattinger S G, Keller B. Development of simple sequence repeat markers specific for the Lr34 resistance region of wheat using sequence information from rice and Aegilops tauschii[J]. TAG, 2006, 113:1049-1062.   [34]Seyfarth R, Feuillet C, Schachermayr G. et al. Development of a molecular marker for the adult plant leaf rust resistance gene Lr35 in wheat[J]. TAG, 1999, 99:554-560.
  [35]Gold J J, Harder D E, Townley-Smith T F, et al. Development of a molecular marker for rust resistance genes Lr39 and Lr35 in wheat breeding lines[J]. Electronic Journal of Biotechnology, 1999, 2(1):35-40.
  [36]魏新燕, 楊文香, 刘大群, 等. 150个小麦品种(系)抗叶锈基因Lr35分子检测[J]. 中国农业科学, 2004, 37(12):1951-1954.
  [37]Mago R, Speilmeyer W, Lawrence G J, et al. Identification and mapping of molecular markers linked to rust resistance genes located on chromosome IRS of rye using wheat rye translocation lines[J]. TAG, 2002, 104:1317-1324.
  [38]Cuthbert P A, Somers D J, Thomas J, et al. Fine mapping Fhbl, a major gene controlling Fusarium head blight resistance in bread wheat (Triticum aestivum L.) [J] . TAG, 2006, 112:1465-1472.
  [39]郎淑平, 王海燕, 胥红研, 等. 小麦抗赤霉病、优质高分子量麦谷蛋白亚基聚合体的分子标记辅助选育[J]. 麦类作物学报, 2008, 28(3):415-418.
  [40]Liu S, Anderson J A. Marker assisted evaluation of Fusarium head blight resistant wheat germplasm[J]. Crop Sci., 2003, 43:760-766.
  [41]蔡士宾, 任丽娟, 颜伟, 等. 小麦抗纹枯病种质创新及QTL定位的初步研究[J]. 中国农业科学, 2006, 39(5):928-934.
  [42]Zhang X, Zhou M, Ren L J, et al. Molecular characterization of Fusarium head blight resistance from wheat variety Wangshuibai[J]. Euphytica, 2004, 139:59-64.
  [43]孙果忠. 小麦重要基因的分子标记实用性评价[D]. 北京:中国农业科学院, 2011.
  [44]胡娜. 小麦抗白粉病基因的分子标记检测及其抗性评价[D]. 合肥:安徽农业大学, 2010.
  [45]雷秀玉. 小麦抗白粉病基因分子标记的实用性评价[D]. 秦皇岛:河北科技师范学院, 2013.山 东 农 业 科 学2017,49(2):10~14Shandong Agricultural Sciences山 东 农 业 科 学第49卷第2期李巧云,等:大白菜抗TuMV分子标记辅助选择技术研究DOI:10.14083/j.issn.1001-4942.2017.02.002
其他文献
大豆的裂荚性是影响其产量的重要因素之一,因此栽培豆中豆荚开裂特性的遗传学机制成为国内外研究的热点。本研究以山东栽培豆(山宁11、山宁17、齐黄34、齐黄35和鲁0305-1)及山
1企业概况西藏康达药业有限公司始建于1996年,主要从事藏药现代化研究、藏药产品的开发、生产和经营,主要产品雪山金罗汉止痛涂膜剂已于1998年经国家卫生部批准为国家三类新
期刊
小麦抗赤霉病基因中,Fhb1基因的抗性最强且最稳定。为了解620份小麦品种(系)Fhb1区段内PFT(pore-forming toxin-like)基因不同等位变异的情况及其地理分布规律,我们采用基因扩增
摘要:为了构建对啤酒花潜隐病毒(HpLV)和啤酒花潜隐类病毒(HpLVd)有抗性的RNAi载体,本研究通过序列比对选取HpLV外壳蛋白基因致病区202 bp和HpLVd 155 bp的保守序列作为干扰序列,以干扰载体pUCCRNAi为基础,成功构建出针对HpLV和HpLVd的双价RNAi载体,通过特异性酶切位点将构建成功的RNAi载体的功能区域连接在植物表达载体pCAMBIA2300-35S-OC
为分析陆地棉春、夏品种杂交RIL群体早熟性、纤维品质及产量性状的遗传变异,揭示春、夏棉杂交选育短季棉品种的遗传机理,创新早熟、优质、高产抗虫棉新种质,本试验以抗虫春棉
高原部队医院科研课题和管理不同于研究所和医科大学的附属医院,其科研课题的规模、内容和目的都有自己特殊的一面,本文结合我院实践,对高原部队医院科研课题的管理谈谈我们的做
期刊
复合蛋白锌是通过生物转化而得到有机微量元素的络合物,在临床应用上无任何毒副作用,收到了令人满意的效果。可以说复合蛋白锌是发展前景广阔的新型生化药物。
为明确黄曲霉(Aspergillus flavus L.)侵染后花生(Arachis hypogaea)种仁的细胞学变化及抗黄曲霉相关种质的群体结构,将黄曲霉菌接种于高抗侵染种质J11和高感病种质泉花10号上,制
1.压封式旋开盖 西班牙维姆威公司是世界上著名的制盖公司。该公司希望提供技术决窍和先进设备,与中方企业合作生产压封式旋开盖,方式为补偿贸易。产品直径规格40—70mm。原