狭叶柴胡β-amyrin合成酶基因的克隆及其蛋白的生物信息学分析

来源 :西南农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuyongqing0820
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[目的]本文拟获得β-amyrin合成酶基因的全长序列及其蛋白的生物学信息.[方法]以狭叶柴胡为材料,获得了抗肝炎有效成分齐墩果酸合成关键酶—β-amyrin合成酶基因的cDNA序列,并应用生物信息数据库(哪个数据库)和分析软件(交代分析软件的类型)对该基因的保守序列、蛋白质理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构、磷酸化位点做了分析.[结果]β-amyrin合成酶基因的ORF核苷酸长度2289 bp,编码762个氨基酸,蛋白质序列中含有氧化鲨烯环化酶家族所特有的且高度保守的DCTAE、QW和MWCYCR3个序列;BsAS无跨膜区,为亲水性蛋白,定位于细胞质中;其二级结构主要为α-螺旋和无规卷曲,三级结构预测结果可信.狭叶柴胡BsAS蛋白共有53个磷酸化位点,其中丝氨酸的磷酸化位点最多.[结论]本研究首次在狭叶柴胡中克隆了BsAS全长基因,同时利用生物信息学分析了其蛋白特性及细胞定位,该研究丰富了BsAS基因资源库,同时为齐墩果烷型代谢产物及代谢途径的深入研究奠定基础.
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