【摘 要】
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从长江口邻近海域沉积物中提取好氧氨氧化细菌(aerobic ammonium-oxidizing bacteria,AOB)的DNA,通过构建硝化作用氨单加氧酶基因文库并划分操作分类单元(OTU)的方法,揭示好
【机 构】
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中国海洋大学海洋环境与生态教育部重点实验室; 上海市气候中心; 中国海洋大学海洋生命学院; 中国海洋大学海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金重大国际(地区)合作项目(40920164004);国家自然科学基金(41076085);海洋公益性行业科研专项(201205031-03)
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从长江口邻近海域沉积物中提取好氧氨氧化细菌(aerobic ammonium-oxidizing bacteria,AOB)的DNA,通过构建硝化作用氨单加氧酶基因文库并划分操作分类单元(OTU)的方法,揭示好氧氨氧化细菌群落结构多样性。结果显示,研究的两个站位(G6站和33站)分别获得417和428个amoA基因克隆,其序列皆属于变形杆菌的β-亚纲,但与此亚纲中已有明确分类信息菌株的amoA基因序列距离较远,相似度较低;利用DOTUR软件将相似度不小于97%的序列归为一个OTU,两站均得到11个OTUs,但离岸较近的G6站沉积物中β-AOB具有较高的多样性,而离岸较远的33站则多样性较低,且两个站位中的优势类群差异明显。
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