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目的对2005年北京地区流行性脑脊髓膜炎(流脑)进行病原学监测。方法对临床流脑病例的血液、脑脊液标本进行特异性核酸片段检测,对鉴定阳性的菌株进行脉冲场凝胶电泳 (PFGE)和多位点序列(MIST)分析。结果在7份血液和5份脑脊液标本中检测到脑膜炎奈瑟菌的核酸片段。共分离到105株脑膜炎奈瑟菌。A群和C群菌株的群内菌株PFGE图谱无差异条带。 MLST分析结果表明北京地区A群脑膜炎奈瑟菌的序列类型主要是ST7,而C群主要是ST4821。结论北京地区目前流脑病例主要由序列类型为ST7的A群和ST4821的C群脑膜炎奈瑟菌引起。