在中国,自收自支事业单位逐渐开始了悠久的创新和完善,在此阶段内,我们看到了很多成果的同时也出现了大量的难题,但是我国目前的经济制度以及经济形式也会对事业单位的建设产生不利影响,因此,在事业单位的风险评估体系建设的过程里就会面临相应的难题与不足,这就要求我们要在以后的实际操作中克服这类难题与不足.当自收自支事业单位完成转制,其身份变为企业时,单位应当具有一套完整的内部控制体系,或者说在转制之前的生产经营活动中,就应具备一个市场经济体制的企业应有的企业风险管理体系,这样才能在单位以后的发展过程中立于不败之地.由于现在的自收自支事业单位受到上级单位的责任督导,导致其在内部监管层面遇到了很多重大的难题,包括监管体系不够完善以及监管形式不够先进等等.但是如果要制定一个健全的监管职能,则必须先制定健全的法人管理形式体系.这就要求自收自支事业单位摒弃现有的管理制度,建立一套适合社会主义市场化经济的体系制度.