【摘 要】
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环境DNA(eDNA)宏条形码(metabarcoding)技术是一种基于分子的生物多样性高效监测手段,近年来越来越多地被应用于生态环境中生物要素的监测和评估.开展eDNA 宏条形码监测技术
【机 构】
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南京大学环境学院,污染控制与资源化国家重点实验室,南京 210023;昆明学院昆明滇池(湖泊)污染防治合作研究中心,昆明 650214;昆明市河湖生态健康评估与修复院士工作站,昆明 650214
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环境DNA(eDNA)宏条形码(metabarcoding)技术是一种基于分子的生物多样性高效监测手段,近年来越来越多地被应用于生态环境中生物要素的监测和评估.开展eDNA 宏条形码监测技术的标准化和规范化研究,是将其业务化推广应用的前提.本研究以高原湖泊滇池和抚仙湖的真核浮游藻类为研究对象,探究了基于18 S-V9 宏条形码测序深度对生物多样性监测的影响;通过分析平行样本间物种分类单元的交叉率及α 多样性的变异率(coefficient of variation,CV),评估了 eDNA 宏条形码监测真核浮游藻类结果的精确性.并采用eDNA 宏条形码监测数据评估了滇池和抚仙湖北的真核藻类多样性.结果表明:①测序深度显著影响宏条形码技术检出物种的数目,适合滇池和抚仙湖北的eDNA 真核藻类多样性分析的测序深度为≥30 000条;②重复样品(n =3)间遗传分类单元(OTU)交叉率达到45.97％±1.67％,可注释分类单元(属)交叉率达到64.21％±3.25％,α多样性的变异率＜10％.③基于现有DNA 条码数据库,滇池和抚仙湖北分别鉴定出真核藻类75 属和90属,覆盖本地历史记录形态学物种的62.5％和71.05％.④滇池不同水深的真核藻类多样性无明显差异,抚仙湖的真核藻类多样性具有显著垂直分布特征.和抚仙湖北部相比,滇池真核藻类多样性显著偏低,滇池南部的生物多样性明显高于中部和北部(P＜0.05).综上,本研究建立了 eDNA 宏条形码技术监测结果的精确性评价方法,验证了基于18S-V9 引物监测真核浮游植物多样性的可行性,结果可促进eDNA 宏条形码监测技术推广与应用.
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