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根据博德特氏菌（Bordetella sp．）的16SrRNA基因序列，设计荧光原位杂交（FISH）检测博德特氏菌的寡核苷酸探针FW_iso_62和Fw_iso_761，存20％～60％甲酰胺均有很强的荧光信号。采用探针FW_iso_62及其竞争探针，结合Nycodenz和DAPI技术，建立定量检测土壤中博德特氏菌的DAPI—FISH方法。该方法可排除土壤颗粒的自动荧光对细菌信号的掩盖，保证图片中有大量微生物供统计分析，还能有效保存微生物的原位信息。应用该方法分析土壤中1，2，4-三氯苯降解菌-博德特氏菌