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为进一步研究淫羊藿属植物种间的亲缘关系,为淫羊藿属植物系统发育及遗传进化分析提供理论依据,本实验采用ITS序列及ISSR标记技术对11种淫羊藿属植物材料的进行亲缘关系分析.ITS序列分析结果表明,11种淫羊藿植物的ITS序列差异不大,其中ITS1长度为227 bp,G+C含量为48.01％～48.46％,ITS2长度为243 bp,G+C含量为51.85％～54.32％;基于ITS序列构建的邻接(NJ)树结果发现,整个聚类树分为2个大支.ISSR分析结果表明,11个材料共扩增出147个位点,其中多态性位点数为133,多态性百分率为90.48％,其中遗传相似性系数为0.523 8～0.700 7.聚类结果显示,基于ITS序列的聚类共分为2个类群,而基于ISSR标记的聚类结果共分为3个类群,表明ISSR分子标记技术比ITS序列分析更能较好的鉴定淫羊藿属植物种间的亲缘关系.