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基于支持向量机的基因组拼接分叉结构处理方法
基于支持向量机的基因组拼接分叉结构处理方法
来源 :智能计算机与应用 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuanjie119
【摘 要】
:
基因组拼接过程中通常会出现分叉,使拼接变得困难。测序碱基错误(sequencing error)是出现分叉的主要原因。针对分叉结构,研究分析分叉处的reads信息,建立SVM预测模型,提出基于
【作 者】
:
朱晓
王亚东
【机 构】
:
哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
【出 处】
:
智能计算机与应用
【发表日期】
:
2015年3期
【关键词】
:
基因组拼接
分叉结构
支持向量机
Genome Assembly
Branch
Support Vector Machine
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基因组拼接过程中通常会出现分叉,使拼接变得困难。测序碱基错误(sequencing error)是出现分叉的主要原因。针对分叉结构,研究分析分叉处的reads信息,建立SVM预测模型,提出基于支持向量机的分叉结构处理方法,取得了较好的效果。
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