【摘 要】
：
利用CD-HIT-EST快速聚类分析和BLASTN同源性比对共鉴定出17个滑液支原体(Mycoplasma synoviae)特有基因,并从中选取保守基因VY93_RS02885作为分子诊断的靶标基因.根据该基因核苷酸序列设计了1对引物,建立了滑液支原体的SYBR green qPCR检测方法.结果表明,该方法对不同浓度的模板和对应的CT值具有较好的线性关系,R2值为0.9988;该方法的特异性较好,BLASTN比对,检测引物对仅能匹配滑液支原体的特有基因VY93_RS02885,结果显示,该方法能特异性
【机 构】
：
江苏省农业科学院兽医研究所/农业部兽医生物工程技术重点实验室,江苏南京210014
论文部分内容阅读
利用CD-HIT-EST快速聚类分析和BLASTN同源性比对共鉴定出17个滑液支原体(Mycoplasma synoviae)特有基因,并从中选取保守基因VY93_RS02885作为分子诊断的靶标基因.根据该基因核苷酸序列设计了1对引物,建立了滑液支原体的SYBR green qPCR检测方法.结果表明,该方法对不同浓度的模板和对应的CT值具有较好的线性关系,R2值为0.9988;该方法的特异性较好,BLASTN比对,检测引物对仅能匹配滑液支原体的特有基因VY93_RS02885,结果显示,该方法能特异性地检测滑液支原体,与其他常见的引起禽关节炎的细菌/支原体性病原无交叉反应;该方法的敏感性较好,100％阳性检测的靶标基因最小拷贝数为10;该方法的重复性较好,对3个不同浓度的模板进行组间和组内重复检测,变异系数≤1.1727％.此外,该方法对临床样品的检出率与传统检测方法相符.因此,本研究建立的针对滑液支原体特有基因的SYBR green qPCR检测方法具有用时短、特异性高、准确性高、敏感性高、可重复性强的优点,可为滑液支原体的快速诊断和流行病学调查提供技术手段.
其他文献
以25个薄壳山核桃品种或优良无性系为研究对象,测定了5月中旬、7月中旬、9月中旬叶片的叶绿素含量、光响应曲线,结果表明,薄壳山核桃叶片的叶绿素含量、最大净光合速率(Pnmax)在25个种质材料间和3个时期间均存在显著性差异,且存在一定的变异性,叶绿素含量高于均值的种质有18个,单叶Pnmax高于均值的种质有12个;叶绿素含量与Pnmax呈极显著正相关(r=0.83**).聚类分析将25份材料聚为3大类,筛选出A1、A2、A3属于高光合性能种质,表现为生育前期和中期的最大净光合速率、叶绿素含量较高,生育后期
基于树木实测数据,转化为迭代函数系统的IFS码,用Matlab软件分别实现合轴分枝树木和单轴分枝树木三维静动态可视化模拟系统,用于城市和园林等的规划与设计。以槐树和松树分别作为合轴分枝树木和单轴分枝树木的代表,提取树高、分枝数、分枝仰角、方位角、枝长等重要信息进行数据统计分析;将父枝(一级枝)和子枝(二级枝)的枝长粗细比、方位角、仰角等参数进行分析推导,得到迭代函数系统的IFS码,并计算出每个仿射
为探讨秸秆生物质炭的氮肥替代效果,在等量生物质炭投入条件下,研究不施肥、常规施肥(不减氮)、减氮15％、减氮30％、减氮45％、减氮100％等6种施肥模式对玉米生长、产量及土壤质量的影响.结果表明,与常规施肥相比,等量生物质炭投入条件下,随着减氮比例的增加,玉米根系构型、叶绿素含量(SPAD值)和净光合速率呈显著降低趋势,减氮15％对玉米根系及植株生长发育、叶片光合作用具有显著促进作用,较常规施肥玉米的总根长、总根表面积、总根体积分别增加了13.5％、17.6％、22.9％;随着减氮比例的增加,玉米产量显
为研究秸秆还田后效对土壤肥力和作物产量的影响,在稻麦轮作下开展了长期钾肥施用和秸秆还田的田间试验,设置了秸秆不还田和不施用钾肥(CK)、秸秆还田(SR),只施用钾肥(K),秸秆还田和配施适量的钾肥(SR+K).结果表明:与CK相比,经过秸秆还田(SR+K、SR)和施用K的处理水稻产量分别提高了17.83％、9.39％和7.96％;秸秆还田处理和钾肥处理的产量无显著差异;SR+K处理的水稻秸秆氮磷钾含量分别显著增加了78.9％、38.5％、152.8％,养分吸收量分别增加41.4％、49.2％和159.2％
马铃薯是我国继小麦、玉米、水稻后的第四大主粮作物,准确模拟马铃薯生育期是预测产量的关键步骤.使用被广泛应用于预测作物生育期的3种温度响应函数(正弦指数函数、WE温度响应函数、Beta函数)和2种日长响应函数(负指数函数、DSSAT-SUBSTOR日长响应函数)组合形成6种光温模型(SN、WN、BN、SD、WD、BD).模型引入各生育期最大日发育速率、临界日长、感光系数和感温系数来描述马铃薯发育过程,使用最大似然法(GLUE)来估计各个光温模型的参数,模型经参数调节后用于预测吉林省马铃薯生育期,旨在对比不同
为探明盐胁迫对黄蜀葵不同部位总黄酮的含量及抗氧化活性影响.采用自吸水梯度鉴定法,研究了梯度盐胁迫下黄蜀葵花、根、茎、叶的总黄酮含量及其抗氧化活性的变化规律,为黄蜀葵功能产品的开发,盐碱地区黄蜀葵产业的发展提供理论依据.结果表明,黄蜀葵不同部位总黄酮含量为花>叶>茎>根.当盐胁迫浓度为2g/L时,黄蜀葵花中总黄酮含量最高,达5.018％,其中,金丝桃苷含量较高,达1.416％;而金丝桃苷在黄蜀葵茎、叶和根中含量利用HPLC法已经无法检出.当盐胁迫浓度在2 g/L时,黄蜀葵花的抗氧化活性最高,T-AOC能力为
以中华猕猴桃良种红阳为试材,研究不同时期、不同宽度环剥对红阳猕猴桃果实品质指标及糖代谢的影响.结果表明,花后30 d,环剥宽度等于结果枝直径的环剥处理可显著提高红阳猕猴桃果实单果质量、可溶性固形物含量、固酸比、维生素C含量(P<0.05),改善果实品质.同时,环剥处理通过相关酶活水平的调节影响糖代谢进程.环剥处理提高了果实发育期内腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGpase)的活性;花后58～156 d,果实蔗糖磷酸合成酶(SPS)活性较对照显著提高;果实发育后期,环剥处理诱导增强果实蔗糖合成酶(SS)活性,
蜗牛是蔬菜田常见有害生物,近年来,随着种植结构、气候因子等因素的影响,我国蔬菜田蜗牛的发生呈逐年加重的趋势,给菜农带来了严重的经济损失.综述蔬菜田中常见的蜗牛种类、生物学特性及发生危害特点,归纳总结目前防治蜗牛的主要技术及农药登记情况,并展望未来蜗牛防控技术研究的发展方向,以期为蔬菜田蜗牛的科学防治及应用基础研究提供参考.
为了明确生物炭和木醋液对土壤磷素流失的影响,提高土壤质量并为农业面源污染风险提供科学依据,以种植蔬菜的高原红壤为研究对象,进行室外白菜盆栽种植试验,设置单施水溶肥(W)、水溶肥配施木醋液(WP)、水溶肥配施生物炭(WB)、水溶肥配施生物炭和木醋液(WPB)4个处理。结果显示,炭醋材料能提高肥料利用率,减少磷素养分的流失;施用炭醋材料后,表层土壤速效磷含量提高,酸性磷酸酶活性增强,难溶性Fe-P、A
克氏原螯虾是我国重要的淡水养殖品种之一,在我国渔业经济发展中起着重要的支撑作用.近年来,我国克氏原螯虾养殖面积和产量快速增长,养殖模式以虾稻连作为主;克氏原螯虾消费量爆发式增长,消费渠道和辐射面日益拓宽;克氏原螯虾精深加工发展迅速,流通体系日趋完善.通过对我国克氏原螯虾产业发展现状的调研分析,对今后我国克氏原螯虾产业发展趋势做出了初步预判:养殖面积增速放缓,产量持续快速攀升;消费需求和消费能力将持续增长;加工产业规模将保持增长态势;市场价格将保持显著季节性波动,同期价格稳中有降;提质增效将成为克氏原螯虾养