河南省HIV流行毒株env膜蛋白基因C2-V3区序列特征和亚型研究

来源 :中国艾滋病性病 | 被引量 : 0次 | 上传用户:down222
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目的了解河南省内艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)流行株的亚型及序列变异特征.方法用套式聚合酶链反应(nested-PCR),对河南省内28份HIV-1感染者外周血单个核细胞(PBMc)中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区350~450个核苷酸序列进行测定和分析.结果 28份样品间的基因离散率为5.72%,与流行于云南省的(泰国B)毒株基因距离为5.80%,与欧美B亚型基因距离为18.05%,而与其它A、C、D、F、G、H、J、O等亚型的基因距离均在24%以上.系统树分析显示,28份样本与泰国B亚型聚在一起而远离其它国际亚型.对于其V3环四肽序列的分析表明,具有泰国B亚型基因型GPGQ的8例,占28.57%;具有欧美B亚型基因型GPGR的13例,占46.4%.结论河南省流行的HIV株属B′亚型,其毒株来自与泰国接壤的云南省,在河南省流行的时间约在6~10年,其V3环顶端四肽序列特征以GPGR为主.
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