马铃薯品种资源遗传多样性的SSR分析

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为了确定马铃薯品种间的亲缘关系远近,选配优良杂交组合提供分子水平上的依据,本实验利用SSR(简单重复序列)标记96个现有马铃薯材料。用20对引物对96个马铃薯材料的基因组DNA进行了扩增,筛选出8对多态性高、谱带清晰的引物。利用8对SSR引物对全部供试材料进行扩增及电泳检测,统计检测结果后用遗传多样性分析软件popgen32. exe分析得到有效等位基因数平均数(ne)为1.56,遗传多样性指数(h)的平均值为0.33,群体的总基因多样性均值为0.33,平均多态位点数量为80。通过用STG0021,STG0020,STG0015,S162,S182,S183,S189,S153总共8对引物对96份供试材料的SSR电泳检测和结果统计分析,用软件ntsys. exe进行聚类分析得到聚类图,由图可知在相似系数0.55处,所有供试材料被聚类为2大类,在相似系数0.66处,所有的材料被分为4类,有亲缘关系较近的3类和亲缘关系较远的1类。亲缘关系较近的3类从分子水平上表明供试材料遗传基础非常狭窄。
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