南京市鼻病毒感染暴发疫情流行病学及病原学特征

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目的 分析南京市鼻病毒(human rhinoviruses,HRV)感染暴发疫情的流行病学及病原学特征。方法 2020年5—6月,南京市江北新区、雨花台区发生HRV感染暴发疫情3起,采集有HRV感染症状人群的咽拭子样本,排除新型冠状病毒及流感病毒感染后,采用实时荧光定量PCR方法检测HRV核酸,用巢式PCR扩增HRV的VP4/2的靶基因,测序后鉴定阳性HRV样本血清型。从GenBank数据库下载HRV各血清型参考株的序列资料,使用MEGA6和BioEdit等软件将测序结果与参考株进行比较分析。结果 累计收集咽拭子样本33份,核酸阳性率60.00%~87.50%,共鉴定出13种血清型,对HRV各组内的核苷酸同源性进行分析,HRV-A组内核苷酸的同源性为75.20%~100.00%,HRV-C组内核苷酸的同源性为72.70%~100.00%。HRV-A组是造成的疫情的主要致病原,HRV-A11和HRV-A29是造成的个体感染数最多的血清型,存在同一起疫情检测出多种血清型的现象。结论 HRV疫情存在多种血清型共流行,A组为主要病原,A11和A29为主要流行的血清型。在不同血清型之间没有交叉免疫,要不断对HRV导致的呼吸道疫情进行深入研究,加强对HRV感染的监测,为HRV的诊断和疫情防控提供科学依据。
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