【摘 要】
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目的比较同一种属同一家族两种相近的简单接头蛋白PDZ结构域结合配体的特性。方法采用酵母双杂交筛选新型随机多肽文库联合高效验证筛选特定PDZ配体库,分别鉴定PDZK1-PDZ1和P
【机 构】
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中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生理与病理生理学系
【基金项目】
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国家自然科学基金杰出青年基金(30725009);国家自然科学基金(30870502);卫生部行业基金(20082007);高等学校博士学科点专项科研基金(20070023021)
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目的比较同一种属同一家族两种相近的简单接头蛋白PDZ结构域结合配体的特性。方法采用酵母双杂交筛选新型随机多肽文库联合高效验证筛选特定PDZ配体库,分别鉴定PDZK1-PDZ1和PDZK2-PDZ1结合线性多肽序列,分析发现两种PDZ结构域结合共有序列特性。通过生物信息学方法比对PDZ结构域,确定结构域中与配体相互接触面位点,进而详细比较这两个相似结构域结合特性的区别及其产生原因。结果分别获得PDZK1-PDZ1和PDZK2-PDZ1的结合特性,发现两者的共有序列分别可以归纳为-[S/T]-x-Φ和-[S/
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