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分析诺如病毒(Novirus, NoV)GII.4型济南JN010株基因组序列及其特征。
方法根据文献并结合PrimerSelect软件设计7对引物，利用RT-PCR方法获得NoV济南JN010株全基因组序列，应用Lasergene7.1、MEGA5.2等软件对基因组序列进行遗传进化、同源比对分析，建立ORF1及ORF2基因系统进化树。并根据VP1氨基酸序列进行突变分析。
结果NoV JN010株基因组序列全长7 516 bp，为GII.Pe/GII.4基因型，属于GII.4 Sydney 2012变异株。突变位点主要发生在VP1的P2区，其中抗原表位A及与组织血型抗原(histo－blood group antigens，HBGAs)结合位点A处发生R297H突变，毗邻抗原表位A位点发生I293N和H373N突变。根据ORF1基因序列，JN010株与日本Osaka源病毒株(GenBank登录号LC066046)亲缘关系较近；根据ORF2基因序列，与广东中山源病毒株(GenBank登录号KY407064)亲缘关系较近。
结论NoV JN010株VP1在抗原表位A及与HBGAs结合位点发生突变，可能影响其抗原性及与HBGAs结合的特异性。